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QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因組擴增試劑
QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因組擴增試劑使用創(chuàng)新的多位移擴增(MDA)技術(shù),從小樣品中提供優(yōu)化的全基因組擴增試劑(WGA)。50μl反應的典型DNA產(chǎn)量高達10μg,平均產(chǎn)物長度大于10kb(范圍在2kb和100kb之間)。*的REPLI-g技術(shù)可從各種小型或珍貴樣品中提供高度均一的WGA,包括純化的基因組DNA,或直接來自新鮮或干燥的血液,新鮮或冷凍組織和細胞。
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QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因組擴增試劑
用于從小或珍貴樣品中進行高度均一的全基因組擴增
- 易于擴增,產(chǎn)量高達10μg
- 基因組基因座的無偏差擴增
- 多位移放大(MDA)帶來可靠的結(jié)果
- 擴增的DNA非常適合大多數(shù)下游應用
- 長期儲存期間沒有DNA降解的風險
REPLI-g Mini Kit使用創(chuàng)新的多位移擴增(MDA)技術(shù),從小樣品中提供優(yōu)化的全基因組擴增試劑(WGA)。50μl反應的典型DNA產(chǎn)量高達10μg,平均產(chǎn)物長度大于10kb(范圍在2kb和100kb之間)。*的REPLI-g技術(shù)可從各種小型或珍貴樣品中提供高度均一的WGA,包括純化的基因組DNA,或直接來自新鮮或干燥的血液,口腔拭子,新鮮或冷凍組織和細胞。這種簡單可靠的方法能夠?qū)蚪M進行準確和無偏的擴增,并生成DNA,無需進一步純化或定量即可應用于不需要標記的下游應用。與基于PCR的WGA技術(shù)相比,
性能
來自各種樣品的高產(chǎn)量,適用于多種應用
使用REPLI-g Mini Kit,可以使用各種臨床和非臨床研究樣本,包括基因組DNA,新鮮或干燥的血液,新鮮或冷凍組織和細胞。每50μl反應的典型DNA產(chǎn)量始終達到10μg,而無論模板DNA的數(shù)量如何,通常都能獲得均一的擴增DNA產(chǎn)量。從不同的模板濃度獲得均勻的DNA產(chǎn)量始終是重要的,但對于高通量應用尤其重要,這需要隨后的遺傳分析,而無需額外測量或調(diào)整DNA濃度。
REPLI-g擴增DNA的平均產(chǎn)物長度通常大于10kb,范圍在2kb和100kb之間,使得能夠進行下游應用,例如復雜的限制酶分析和長程PCR。REPLI-g擴增的DNA非常適用于基因分型應用,例如使用TaqMan®引物/探針組進行SNP基因分型,測序和STR /微衛(wèi)星分析。
成功用于下一代測序
許多出版物已經(jīng)證明REPLI-g擴增DNA成功應用于下一代測序(NGS)應用,包括從腫瘤細胞的外顯子組和全基因組測序,到宏基因組學研究,到單細胞分析(對于一系列近期出版物而言)在NGS中成功使用REPLI-g,請參閱我們的WGA資源頁面)。由于使用全基因組擴增的DNA用于NGS和陣列應用已經(jīng)引起爭議,我們檢測到可能影響使用擴增DNA用于這些下游應用的成功的潛在因素。我們確定輸入材料的質(zhì)量強烈影響下游NGS實驗的成功。如果使用低質(zhì)量DNA(例如,降解的DNA)或老化的組織材料,所得到的擴增的DNA可能不會給出可靠的結(jié)果(數(shù)據(jù)未顯示)。然而,使用REPLI-g技術(shù)的WGA在完整細胞或未降解的純化DNA上顯示NGS結(jié)果與用純化的gDNA獲得的結(jié)果相當?;蚪M基因座序列的序列覆蓋和比對比較表明WGA后的垃圾DNA水平小化,而擴增和基因組DNA的錯誤率在相似的百分比范圍內(nèi)。
高保真全基因組擴增
REPLI-g技術(shù)在整個基因組中提供高度均一的DNA擴增。Phi29聚合酶可復制高達70kb而不與基因組DNA模板解離。與基于PCR的全基因組擴增(WGA)技術(shù)相比,Phi29聚合酶具有3'→5'核酸外切酶校正活性,并且在復制期間與Taq DNA聚合酶相比保持高達1000倍的保真度。試劑盒中提供的外切核酸酶抗性引物可確保高產(chǎn)量的DNA產(chǎn)物,WGA緩沖系統(tǒng)針對非常長的閱讀長度和無偏的基因座表現(xiàn)進行了優(yōu)化。
REPLI-g優(yōu)于基于PCR的WGA方法
傳統(tǒng)的基因組DNA擴增方法包括創(chuàng)建EBV轉(zhuǎn)化細胞系的耗時過程,然后使用隨機或簡并寡核苷酸引發(fā)的PCR進行全基因組擴增。此外,如其他供應商通常使用的基于PCR的方法(例如,DOP-PCR和PEP)可以產(chǎn)生非特異性擴增假象并且給出基因座的不*覆蓋。在一些情況下,可能產(chǎn)生小于1kb長的DNA,其不能用于許多下游應用中。通常,由于使用低保真酶Taq,產(chǎn)生的DNA具有高得多的突變率DNA聚合酶,可導致容易出錯的擴增,導致例如單堿基對突變,STR收縮和擴增。與這些缺點相反,REPLI-g在整個基因組中提供高度均一的擴增,在擴增過程中具有小的基因座偏差和小的突變率(參見“ 使用REPLI-g技術(shù)的高度代表性擴增 ”和“ *且準確的全基因組擴增 ”) )。
原理
*的REPLI-g技術(shù)使用創(chuàng)新的高保真酶Phi 29聚合酶,使用多重置換擴增(MDA)和溫和的堿性變性步驟擴增復雜的基因組DNA,以均勻地擴增基因組位點。REPLI-g Mini Kit的典型產(chǎn)量高達10μg,可以根據(jù)您的需要使用REPLI-g Midi Kit輕松按比例縮小,因為兩種試劑盒都基于相同的方案并使用相同的反應體積。簡單的反應設(shè)置和約15分鐘的極低處理時間使得REPLI-g成為一種簡單可靠的方法,當需要有限或珍貴樣品的完整和無偏的軌跡表示時。
放大原理
REPLI-g使用等溫基因組擴增,稱為多位移擴增(MDA),其涉及隨機六聚體與變性DNA的結(jié)合,然后使用酶Phi29聚合酶在恒定溫度下進行鏈置換合成。在用作模板的每個置換鏈上發(fā)生另外的引發(fā)事件,使得能夠產(chǎn)生高產(chǎn)量的擴增DNA。Phi 29聚合酶是一種噬菌體衍生酶,是一種具有3'→5'主要核酸外切酶活性(校對活性)的DNA聚合酶,與Taq相比,其保真度高達1000倍。DNA聚合酶。在*,優(yōu)化的REPLI-g緩沖系統(tǒng)的支持下,Phi 29聚合酶可輕松解決二級結(jié)構(gòu),如發(fā)夾環(huán),從而防止聚合酶在擴增過程中滑脫,停止和解離。這使得能夠產(chǎn)生高達100kb的DNA片段而沒有序列偏。
DNA的堿性變性
基因組DNA在用于酶擴增程序之前必須變性,這通常使用苛刻的方法完成,例如在升高的溫度下孵育(加熱孵育)或增加的pH(化學堿性孵育)。REPLI-g Midi Kit使用溫和的堿性孵育,允許均勻的DNA變性,DNA碎片非常低或產(chǎn)生無堿基位點。這導致擴增的DNA具有非常高的完整性,并使擴增片段的長度大化,從而均勻地表示基因組基因座和序列。使用REPLI-g Mini Kit,可確保在后續(xù)下游應用中獲得可靠的結(jié)果,而不會出現(xiàn)假陽性或陰性數(shù)據(jù),這與其他使用熱誘導變性的WGA技術(shù)不同,后者會損害模板DNA,從而導致偏向和代表性不足的位點
程序
簡單,一管程序
REPLI-g Mini Kit使用簡單可靠的方法從少量分離的靶基因組DNA或直接從全血,干血卡,血沉棕黃層和組織培養(yǎng)細胞中獲得準確的基因組擴增。加入裂解緩沖液,裂解樣品材料并使DNA變性,然后進行短時間的孵育。中和后,加入預混合物(包括REPLI-g Mini DNA聚合酶),等溫擴增反應在30℃下進行過夜。REPLI-g擴增的DNA可以在-20°C下長期保存,沒有負面影響。
應用
REPLI-g擴增基因組可用于多種下游應用,包括:
- 使用TaqMan®引物/探針組進行SNP基因分型
- 基于qPCR和PCR的突變檢測
- 新一代測序
- STR /微衛(wèi)星分析
- 桑格測序
- RFLP和Southern印跡分析
- 陣列技術(shù),如比較基因組雜交
QIAGEN REPLI-g Mini Kit 全基因組擴增試劑
QIAGEN REPLI-g Mini Kit產(chǎn)品訂購信息
品牌 產(chǎn)品貨號 產(chǎn)品名稱
QIAGEN 150023 REPLI-g Mini Kit (25)
QIAGEN 150025 REPLI-g Mini Kit (100)
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