Rubicon PicoPLEX
英文名:Rubicon PicoPLEX WGA Kit
中文名:Rubicon單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒
☆ 單細(xì)胞或6pg基因組DNA起始的全基因組DNA擴(kuò)增試劑盒。
☆ 單個(gè)反應(yīng)管、3小時(shí),3步反應(yīng)的簡(jiǎn)單操作流程(手動(dòng)操作時(shí)間只需要15分鐘)。
☆ 適合拷貝數(shù)變異分析(CNV)、染色體異倍性(aneuploidy)分析。
PicoPLEX WGA Kit采用技術(shù),設(shè)計(jì)優(yōu)化用于從單細(xì)胞中擴(kuò)增全基因組DNA。起始樣本量低至單細(xì)胞或6pg基因組DNA。便捷的單管操作流程降低污染節(jié)省時(shí)間。結(jié)果穩(wěn)定性、重復(fù)性好。
應(yīng)用推薦:PGS/PGD,單細(xì)胞NIPT,循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析
Rubicon PicoPLEX用于NIPT的文獻(xiàn)
文獻(xiàn)范圍:2014年以后發(fā)表的文獻(xiàn)
應(yīng)用概述:PicoPLEX單細(xì)胞擴(kuò)增所得文庫(kù)在下游單細(xì)胞的STR、CNV、SNP等遺傳變異檢測(cè)表現(xiàn)良好,適用于單細(xì)胞產(chǎn)前無(wú)創(chuàng)檢測(cè)。
1.
文獻(xiàn):Short Tandem Repeat analysis after Whole Genome Amplification of single B-lymphoblastoid cells.(B淋巴母細(xì)胞系單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增后的微衛(wèi)星分析)
Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室),et al.
Scientific Reportsvolume 8, Article number: 1255 (2018)
遺傳變異檢測(cè):短串聯(lián)重復(fù)序列,英文Short Tandem Repeat,簡(jiǎn)稱STR。又稱微衛(wèi)星(Microsalite),簡(jiǎn)單重復(fù)序列(英語(yǔ):Simple Sequence Repeats,SSRs)。
意義:使用單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增(WGA)試劑,以用于下游的單細(xì)胞微衛(wèi)星分析。可用于基于單細(xì)胞檢測(cè)的無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)。
Rubicon PicoPLEX作用:PicoPLEX雖然沒(méi)有檢測(cè)到所有微衛(wèi)星標(biāo)記,但仍適用于臨床單細(xì)胞的遺傳學(xué)鑒別。
2.
文獻(xiàn):STR profiling and Copy Number Variation analysis on single, preserved cells using current Whole Genome Amplification methods.(使用現(xiàn)行全基因組擴(kuò)增方法對(duì)單個(gè)保存細(xì)胞進(jìn)行STR和染色體拷貝數(shù)變異分析)
Ann-Sophie Vander Plaetsen(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室),et al.
Scientific Reportsvolume 7, Article number: 17189 (2017)
遺傳變異檢測(cè)
STR
CNV:英文 Copy Number Variation,染色體拷貝數(shù)變異
意義:?jiǎn)渭?xì)胞無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)等液體活檢因?yàn)榧?xì)胞的稀有和脆弱,需要更的單細(xì)胞分析技術(shù)。PicoPLEX等單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒可以對(duì)微量DNA進(jìn)行無(wú)偏向的WGA擴(kuò)增,以用于下游STR和CNV分析。
方法:細(xì)胞用Streck Cell-Free DNA BCT 采血管保存,使用PicoPLEX等WGA試劑盒進(jìn)行單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增后進(jìn)行STR與CNV分析。
Rubicon PicoPLEX作用:在幾種WGA試劑盒中,PicoPLEX表現(xiàn)良好,對(duì)于STR和CNV均適用。
3.
文獻(xiàn):Performance of four modern whole genome amplification methods for copy number variant detection in single cells.(四種全基因組擴(kuò)增方法用于單細(xì)胞拷貝數(shù)變異檢測(cè)的性能表現(xiàn))
Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室),et al.
遺傳變異檢測(cè):CNV
意義:?jiǎn)渭?xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù)可用于胚胎植入前遺傳診斷,單細(xì)胞無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)和循環(huán)腫瘤細(xì)胞的液體活檢。即PGD、NIPT和CTC。
Rubicon PicoPLEX作用:PicoPLEX試劑擴(kuò)增單細(xì)胞后,適合通過(guò)低深度全基因組大規(guī)模平行測(cè)序(MPS,又名NGS)進(jìn)行CNV分析。
4.
文獻(xiàn):Evidence for feasibility of fetal trophoblastic cell‐based noninvasive prenatal testing.(胎兒滋養(yǎng)細(xì)胞用于單細(xì)胞無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)可行性的證據(jù))
Amy M. Breman(Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫(yī)學(xué)院 分子與人類遺傳學(xué)系),et al.
PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 12 September 2016.
遺傳變異檢測(cè):染色體和亞染色體變異
意義:通過(guò)孕早期(10-16周期)母體血液獲得胎兒細(xì)胞,單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增后,進(jìn)行基因分型。
方法
擴(kuò)增:WGA技術(shù)
分析:array CGH 或 NGS
Rubicon PicoPLEX作用:用于單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增。
5.
文獻(xiàn):Comparison of three whole genome amplification methods for detection of genomic
aberrations in single cells.(三種用于單細(xì)胞基因組結(jié)構(gòu)異常檢測(cè)的全基因組擴(kuò)增方法比較)
Elizabeth Normand(Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫(yī)學(xué)院 分子與人類遺傳學(xué)系),et al.
PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 02 July 2016
Keywords: Whole genome amplification, array CGH, genotyping, non-invasive prenatal
diagnosis, fetal cells
關(guān)鍵詞:全基因組擴(kuò)增,微陣列比較基因組雜交,基因分型,無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷,胎兒細(xì)胞
遺傳變異檢測(cè):染色體拷貝數(shù)異常
意義:比較了三種商業(yè)全基因組擴(kuò)增(WGA)試劑盒從單細(xì)胞中獲得高質(zhì)量DNA的能力。結(jié)果顯示W(wǎng)GA試劑所得DNA文庫(kù)適合用于單細(xì)胞分子分型和拷貝數(shù)分析。
Rubicon PicoPLEX作用:PicoPLEX相比其他品牌試劑盒對(duì)于非固定細(xì)胞的SNP檢測(cè)較好。
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品牌 | 貨號(hào) | 產(chǎn)品描述 | 包裝 |
Rubicon | RB3050 / R30050 | PicoPLEX WGA Kit | 50Rxns |
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