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技術(shù)支持

Rubicon WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒說明書
更新時間:2017-11-06   點擊次數(shù):3278次

A 產(chǎn)品組成—PicoPLEX WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒

 

組份

蓋子顏色

Cell Extraction Buffer

細胞提取緩沖液

綠色

Extraction Enzyme Dilution Buffer 提取酶稀釋緩沖液

紫色

Cell Extraction Enzyme 細胞提取酶

黃色

Pre-Amp Buffer 預(yù)擴增緩沖液

紅色

Pre-Amp Enzyme 預(yù)擴增酶

白色

Amplification Buffer 擴增緩沖液

桔色

Amplification Enzyme 擴增酶

藍色

Nuclease-Free water 無核酸酶水

無色

User Manual 使用手冊

 

試劑量可供50次反應(yīng)。

 

B PicoPLEX WGA Kit儲存與處理

-20℃儲存。

使用前,細胞提取酶、預(yù)擴增酶和擴增酶組份放到冰上。其他組份使用前在冰上解凍并且稍微漩渦振蕩(vortex and quick-spin)。

試劑儲存、處理和反應(yīng)設(shè)置都要遵守實驗室PCR操作規(guī)范。

 

C單細胞全基因組擴增試劑盒其他準(zhǔn)備材料

熱循環(huán)儀(PCR儀,推薦使用實時PCR儀)

PCR管或96孔PCR板

低吸附吸頭(Low-binding barrier tips)

磷酸鹽緩沖液(PBS)

 

D PicoPLEX WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒產(chǎn)品描述

單管,3步,PicoPlEX WGA試劑盒專門用于人單細胞和pg級DNA的擴增,具有可重復(fù)性、低背景的特點。3小時內(nèi)完成細胞裂解、熱循環(huán)文庫制備和低背景擴增,zui終能得到2-5µg擴增DNA。

 

 

PicoPLEX單細胞全基因組擴增流程

細胞+裂解/提取緩沖液,15min ——預(yù)擴增混合液,90min ——擴增混合液,30min ——分析

 

PicoPLEX WGA Kit適用樣本

1.1-10個人細胞,如:囊胚細胞、極體、滋胚層細胞、羊水細胞、循環(huán)腫瘤細胞、培養(yǎng)細胞等。

2.1000-10000個細菌細胞

3.分離DNA(15pg-50pg人DNA)

4.分選染色體(Sorted Chromosomes )

5.不完整或片段化,單/雙鏈DNA

6.樣本zui大體積:5µL

 

E PicoPLEX WGA全基因組擴增產(chǎn)物應(yīng)用

拷貝數(shù)變異(CNV)分析,基于oligonucleotide aCGH, BAC aCGH, or qPCR

SNP 基因表型

突變檢測

 

F PicoPLEX單細胞全基因組擴增細胞樣本采集

細胞采集方法

兼容PicoPLEX WGA Kit的正確細胞采集方法有流式分選術(shù),稀釋和顯微操作。細胞染色后可能會對試劑盒性能造成不好影響。為了得到*結(jié)果,一定要避免使用福爾馬林固定法。

細胞洗滌

細胞樣本制備時強烈推薦用PBS洗滌,以盡量減少非細胞DNA污染。選擇不含鎂、鈣、BSA的PBS。zui終細胞樣本中所含PBS體積不能超過2.5µL。

 

G 使用擴增后的對照DNA作為參照

DNA對照樣本對于某些如微陣列和qPCR平臺有參照價值。為了得到更準(zhǔn)確的結(jié)果,強烈推薦PicoPLEX擴增樣本的對照選擇PicoPLEX擴增后的DNA對照而不是沒有擴增的DNA對照。

DNA對照樣本按樣本配制方法(J)配制,按PicoPLEX操作步驟(K)擴增。Pooling DNA對照的擴增反應(yīng)的產(chǎn)物可以得到*結(jié)果。

 

H PicoPLEX WGA全基因組擴增產(chǎn)物純化和定量

WGA單細胞全基因組擴增產(chǎn)物用于下游時,許多應(yīng)用使用前需要純化和定量。純化方法可以使用 spin columns或過濾板。

產(chǎn)物定量使用紫外吸光度法(UV absorbance ,1 OD260 = 50 µg/mL)。PicoGreen™或其他雙鏈DNA定量法所得PicoPLEX產(chǎn)物密度可能不可靠。

純化后的PicoPLEX擴增產(chǎn)物-20 °C儲存。

 

I 選擇合適的反應(yīng)管/反應(yīng)板

PicoPLEX操作指南的步驟7中,如果孵育時PCR管/板密封性不夠,會造成大量(>5 µL)的試劑蒸發(fā),zui終影響PicoPLEX WGA結(jié)果的穩(wěn)定性和重復(fù)性。

步驟7也可以加15 µL 水,無視所選反應(yīng)管/板密封性能否盡量減少蒸發(fā)造成的體積損失。(A mock PicoPLEX Protocol Step 6 incubation using 15 µL of water is advised to confirm whether a selected tube or plate/seal combination can be used with minimal volume loss due to evaporation.)

 

J樣本配制方法

5µL細胞樣本

1.依照F所述方法用PBS稀釋或淋洗細胞。

2.如果采用流式分選采集細胞:

單個細胞加入含5 µL細胞提取緩沖液(綠蓋)的PCR管/孔。

如果采用顯微操作或稀釋法

單個細胞先用zui少PBS(<2.5 µL))混合,再加入含適量細胞提取緩沖液(綠蓋)的PCR管/孔,zui終樣本體積5 µL。

  1. 配制好的細胞立即 -80 °C 凍存或直接進行擴增操作。

 

5µL DNA樣品(單細胞simulation)

1.配制1 ng/µL 純化DNA溶液:PCR管/孔中,5 mM Tris-HCl (pH8.0)稀釋對照DNA。

2.漩渦振蕩30s。

3.配制15 pg/µL DNA溶液:3µL 1 ng/µL DNA溶液+197 µL 5 mM Tris-HCl (pH 8.0)。

4.漩渦振蕩30s。

5.PCR管/孔中,1 µL 15 pg/µL DNA溶液+ 4 µL 細胞提取緩沖液(綠蓋)。

 

K PicoPLEX操作步驟

細胞提取

1.添加提取混合液各組份并充分混勻。

Extraction Cocktail Component

提取混合液組份

蓋子顏色

Extraction Enzyme Dilution Buffer 提取酶稀釋緩沖液

紫色

Cell Extraction Enzyme細胞提取酶

黃色

 

2.每5µL細胞樣本或DNA樣本(J部分配制)加5 µL新鮮配制的提取混合液。

3.按下表在熱循環(huán)儀中孵育樣本:

1 cycle

75 °C

10 min

1 cycle

95 °C

 4 min

1 cycle

室溫

Hold

 

4.試管/板稍微離心。

 

預(yù)擴增

5.添加預(yù)擴增混合液各組份并充分混勻。

Pre-Amp Cocktail Component 

預(yù)擴增混合液各組份

蓋子顏色

Pre-Amp Buffer 預(yù)擴增緩沖液

紅色

Pre-Amp Enzyme 預(yù)擴增酶

白色

 

6.每個細胞樣本/DNA樣本加5µL預(yù)擴增混合液。

7.按下表在熱循環(huán)儀中孵育樣本:

1 cycle

95°C

2 min

12 cycles

95°C

15 s

15°C

50 s

25°C

40 s

35°C

30 s

65°C

40 s

75°C

40 s

1 cycle

4°C

Hold

 

8.稍微離心,預(yù)擴增孵育產(chǎn)物放到冰上。

擴增

9.添加擴增混合液各組份并充分混勻。

 

Amplification Cocktail Component

擴增混合液組份

蓋子顏色

Amplification Buffer 擴增緩沖液

桔色

Amplification Enzyme 擴增酶

藍色

Nuclease-Free Water 無核酸酶水

透明

 

注意:樣本擴增效率可以通過在擴增混合液中添加SYBR Green I dye(zui終密度:0.125x)進行實時PCR儀分析。一些儀器需要額外添加其他染色劑做信號歸一化(signal normalization)。

10. 新鮮配制的擴增混合液取60 µL和15 µL預(yù)擴增孵育產(chǎn)物混合,吸管混勻。

11.按下表在熱循環(huán)儀中擴增樣本:

 

1 cycle

95 °C

2 min

14 cycles

95°C

15 s

65°C

1 min

75°C

1 min

1 cycle

4°C

hold

 

注意:基于Rubicon用流式分選培養(yǎng)細胞的測試,推薦14 cycles。一些細胞類型要獲得zui高產(chǎn)量,可能需要更多cycles(zui高達16 cycles)。

12.PicoPLEX 擴增產(chǎn)物立即 -20 °C儲存或用于下游純化(見H)。

 

RB3050 Rubicon PicoPLEX WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒說明書由華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司:紅榮微再翻譯。

 

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RB3050 Rubicon PicoPLEX WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒

從單細胞中擴增DNA構(gòu)建高重復(fù)性的文庫現(xiàn)在成為可能。PicoPLEX WGA kit采用技術(shù),設(shè)計、優(yōu)化用于從單細胞中擴增單拷貝基因組DNA。起始量低至單細胞或6pg基因組DNA。便捷的單管操作流程減少失誤,節(jié)省時間并降低反應(yīng)背景。

PicoPLEX WGA Kit兼容微陣列比較基因組雜交(array CGH)分析及PCR平臺,試管嬰兒行業(yè)供應(yīng)商如BlueGnome信賴并用于PGS/PGD


產(chǎn)品訂購信息

貨號

產(chǎn)品名稱

包裝

RB3050/R30050

 PicoPLEX WGA Kit單細胞全基因組擴增試劑盒,array CGH、PCR分析用

50次反應(yīng)

RB3381/R300381

PicoPLEX DNA-seq Kit,48種雙端illumina引物

48

 

 

選購RB3050 Rubicon PicoPLEX WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒產(chǎn)品歡迎您致電 華雅再生醫(yī)學(xué)旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司 :152 1681 4001。華雅再生醫(yī)學(xué)-客服: 316 808 6348。

紅榮微再(上海)生物工程技術(shù)有限公司以“傳遞科學(xué)價值,服務(wù)科學(xué)研究”為宗旨,主營:干細胞、醫(yī)療、細胞治療、器官再生 四大板塊的產(chǎn)品。

 

紅榮微再醫(yī)療宣傳冊

 

 

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